Python 存取npy格式数据实例
数据处理的时候主要通过两个函数
(1):np.save(“test.npy”,数据结构) ----存数据
(2):data =np.load(’test.npy') ----取数据
给2个例子如下(存列表)
1、
z = [[[1, 2, 3], [’w’]], [[1, 2, 3], [’w’]]]np.save(’test.npy’, z)x = np.load(’test.npy’)x:->array([[list([1, 2, 3]), list([’w’])], [list([1, 2, 3]), list([’w’])]], dtype=object)
2、存字典
x-> {0: ’wpy’, 1: ’scg’}np.save(’test.npy’,x)x = np.load(’test.npy’)x->array({0: ’wpy’, 1: ’scg’}, dtype=object)
3、在存为字典格式读取后,需要先调用如下语句
data.item()
将数据numpy.ndarray对象转换为dict
补充知识:python读取mat或npy文件以及将mat文件保存为npy文件(或npy保存为mat)的方法
读取mat文件并存为npy格式文件
具体见代码,注意h5py的转置问题
import numpy as npfrom scipy import iomat = io.loadmat(’yourfile.mat’)# 如果报错:Please use HDF reader for matlab v7.3 files# 改为下一种方式读取import h5pymat = h5py.File(’yourfile.mat’)# mat文件里可能有多个cell,各对应着一个dataset# 可以用keys方法查看cell的名字, 现在要用list(mat.keys()),# 另外,读取要用data = mat.get(’名字’), 然后可以再用Numpy转为arrayprint(mat.keys())# 可以用values方法查看各个cell的信息print(mat.values())# 可以用shape查看维度信息print(mat[’your_dataset_name’].shape)# 注意,这里看到的shape信息与你在matlab打开的不同# 这里的矩阵是matlab打开时矩阵的转置# 所以,我们需要将它转置回来mat_t = np.transpose(mat[’your_dataset_name’])# mat_t 是numpy.ndarray格式# 再将其存为npy格式文件np.save(’yourfile.npy’, mat_t)
npy文件的读取很简单
import numpy as np
matrix = np.load(’yourfile.npy’)
可以重新读取npy文件保存为mat文件
方法一(在MATLAB双击打开时遇到了错误:Unable to read MAT-file *********.mat. Not a binary MAT-file. Try load -ASCII to read as text. ):
import numpy as npmatrix = np.load(’yourfile.npy’)f = h5py.File(’yourfile.mat’, ’w’)f.create_dataset(’dataname’, data=matrix)# 这里不会将数据转置
方法二(使用scipy):
from scipy import iomat = np.load(’rlt_gene_features.npy-layer-3-train.npy’)io.savemat(’gene_features.mat’, {’gene_features’: mat})
以上这篇Python 存取npy格式数据实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持好吧啦网。
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