python读取hdfs上的parquet文件方式
在使用python做大数据和机器学习处理过程中,首先需要读取hdfs数据,对于常用格式数据一般比较容易读取,parquet略微特殊。从hdfs上使用python获取parquet格式数据的方法(当然也可以先把文件拉到本地再读取也可以):
1、安装anaconda环境。
2、安装hdfs3。
conda install hdfs3
3、安装fastparquet。
conda install fastparquet
4、安装python-snappy。
conda install python-snappy
5、读取文件
##namenode mode:from hdfs3 import HDFileSystemfrom fastparquet import ParquetFile hdfs = HDFileSystem(host=IP, port=8020)sc = hdfs.open pf = ParquetFile(filename, open_with=sc)df = pf.to_pandas() ##返回pandas的DataFrame类型 ##HA mode:from hdfs3 import HDFileSystemfrom fastparquet import ParquetFile host = 'nameservice1'conf = { 'dfs.nameservices':'nameservice1', ......}hdfs = HDFileSystem(host = host, pars = conf)......
python访问HDFS HA的三种方法
python访问hdfs常用的包有三个,如下:
1、hdfs3
其实从安装便捷性和使用上来说,并不推荐hdfs3,因为他的系统依赖和网络要求较高,但是某些情况下使用hdfs3会比较方便,官网资料点这里。如上面介绍,IP直接访问namenode:
from hdfs3 import HDFileSystemhdfs = HDFileSystem(host=namenode, port=8020)hdfs.ls(’/tmp’)
HA访问:
host = 'nameservice1'conf = {'dfs.nameservices': 'nameservice1', 'dfs.ha.namenodes.nameservice1': 'namenode113,namenode188', 'dfs.namenode.rpc-address.nameservice1.namenode113': 'hostname_of_server1:8020', 'dfs.namenode.rpc-address.nameservice1.namenode188': 'hostname_of_server2:8020', 'dfs.namenode.http-address.nameservice1.namenode188': 'hostname_of_server1:50070', 'dfs.namenode.http-address.nameservice1.namenode188': 'hostname_of_server2:50070', 'hadoop.security.authentication': 'kerberos'}fs = HDFileSystem(host=host, pars=conf) ##或者下面这种配置host = 'ns1'conf = { 'dfs.nameservices':'ns1', 'dfs.ha.namenodes.ns1':'namenode122,namenode115', 'dfs.namenode.rpc-address.ns1.namenode122':'nnlab01:8020', 'dfs.namenode.servicerpc-address.ns1.namenode122':'nnlab01:8022', 'dfs.namenode.http-address.ns1.namenode122':'nnlab01:50070', 'dfs.namenode.https-address.ns1.namenode122':'nnlab01:50470', 'dfs.namenode.rpc-address.ns1.namenode115':'nnlab02:8020', 'dfs.namenode.servicerpc-address.ns1.namenode115':'nnlab02:8022', 'dfs.namenode.http-address.ns1.namenode115':'nnlab02:50070', 'dfs.namenode.https-address.ns1.namenode115':'nnlab02:50470',}hdfs = HDFileSystem(host = host, pars = conf)
2、hdfs
这种方法在使用的时候配置比较简单,官网资料也比较丰富,但是需要注意的是该API可以模拟用户访问,权限较大。IP直接访问:
import hdfsclient = hdfs.client.InsecureClient(url='http://namenode:50070', user='hdfs')
HA访问:
import hdfsclient = hdfs.client.InsecureClient(url='http://namenode1:50070;http://namenode2:50070', user='hdfs')
3、pyhdfs
安装命令:pip install PyHDFS
官网地址,直接访问:
import pyhdfsclient = pyhdfs.HdfsClient(hosts='namenode:50070',user_name='hdfs')
HA访问
import pyhdfsclient = pyhdfs.HdfsClient(hosts=['namenode1:50070','namenode2:50070'],user_name='hdfs')
补充知识:python spark中parquet文件写到hdfs,同时避免太多的小文件(block小文件合并)
在pyspark中,使用数据框的文件写出函数write.parquet经常会生成太多的小文件,例如申请了100个block,而每个block中的结果
只有几百K,这在机器学习算法的结果输出中经常出现,这是一种很大的资源浪费,那么如何同时避免太多的小文件(block小文件合并)?
其实有一种简单方法,该方法需要你对输出结果的数据量有个大概估计,然后使用Dataframe中的coalesce函数来指定输出的block数量
即可,具体使用代码如下:
df.coalesce(2).write.parquet(path,mode)
这里df是指你要写出的数据框,coalesce(2)指定了写到2个block中,一个block默认128M,path是你的写出路径,mode是写出模式,常用的是
'overwrite'和'append'。
以上这篇python读取hdfs上的parquet文件方式就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持好吧啦网。
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